“run”有“路程”的意思，in the long run这个短语的意思是“长远来说”。

【例句】
This measure inevitably means higher taxes in the long run.
从长远来看这项举措的结果就是要多纳税。

These changes will cost a lot, but they will save us money in the long run.
这些改动相当花钱，但从长远的角度看会为我们省钱。